El acetato, el propionato y el butirato de ácidos grasos de cadena corta (AGCC) son los productos finales de la descomposición de los carbohidratos por parte de las bacterias anaeróbicas en el colon. Es posible que nos estén devolviendo dinero, como el alquiler, por haberles brindado un refugio seguro en el colon mediante la producción de butirato. El proceso es básicamente la fermentación y es una función importante del intestino grueso. Gran parte de la microflora normal produce butirato a partir de fibra vegetal completamente digerida y parece ser el principal combustible para las células que recubren el colon. La producción y la absorción de los ácidos grasos esenciales están estrechamente relacionadas con la nutrición de la mucosa del colon, ya que contienen una cantidad considerable de energía como subproducto derivado de la descomposición de los carbohidratos. El butirato es metabolizado fácilmente por nuestros colonocitos, el intestino lo absorbe fácilmente, estimula la absorción de sodio y agua en el colon y es fundamental para la mucosa intestinal. Se ha demostrado clínicamente que el butirato es útil para secuestrar y controlar el amoniaco en pacientes con hiperamonemia, como en pacientes con trastornos convulsivos, confusión mental y accidentes cerebrovasculares. Rudolfo Brenner ha propuesto que el butirato elimina del hígado los ácidos grasos renegados (ácidos grasos impares y de cadena muy larga) y es un coadyuvante principal en los estados de toxicidad.